Ceci est une ancienne révision du document !
Épitopes de la protéine "hémagglutinine"
Ce texte a été rédigé par Christian Klopfenstein avec les informations de Robert Charette et l'assitance de Google Gemini. Les informations proviennent des articles en référence.
Un épitope (ou déterminant antigénique) est la région spécifique d'une macromolécule (généralement une protéine ou un polyoside) qui est reconnue de manière ciblée par le système immunitaire.
Les épitopes de la tête globulaire de l'hémagglutinine ont été identifié dans les années 1980 et ils sont aujourd'hui fréquemment utilisé pour la sélection des vaccins influenza.
- Sites A, B, C, D, E (H3) : Établis par Wiley, Wilson et Skehel (1981) (Nature) grâce à la cristallographie aux rayons X et au séquençage de mutants d'échappement sélectionnés par anticorps monoclonaux.
- Sites Sa, Sb, Ca1, Ca2, Cb (H1) : Cartographiés par Gerhard, Yewdell et leurs collaborateurs (1981) (Nature / Journal of Experimental Medicine) selon la même approche expérimentale.
Adaptation par l'équipe du CDPQ
Les acides aminés représentés par ces épitopes sont retrouvés dans les rapports générés par l'outil OCVIP. A titre d'exemples voir: h1n1pan_vipar2026.pdf et h3n2_2010.1_vipar2026.pdf
Épitopes retenus pour les H1 (nombre d'acides aminés)
- Sa (13 aa)
- Sb (10 aa)
- Ca1 (12 aa)
- Ca2 (8 aa)
- Cb (6 aa)
Épitopes retenu pour les H3 (nombre d'acides aminés)
- A (19 aa)
- B (22 aa)
- C (27 aa)
- D (41 aa)
- E (22 aa)
Références
Brownlee, G. G., et E. Fodor. 2001. « The Predicted Antigenicity of the Haemagglutinin of the 1918 Spanish Influenza Pandemic Suggests an Avian Origin ». Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences 356 (1416): 1871‑76. https://doi.org/10.1098/rstb.2001.1001.
Caton, Andrew J., George G. Brownlee, Jonathan W. Yewdell, et Walter Gerhard. 1982. « The antigenic structure of the influenza virus A/PR/8/34 hemagglutinin (H1 subtype) ». Cell 31 (2, Part 1): 417‑27. https://doi.org/10.1016/0092-8674(82)90135-0.
Deem, M. W., et K. Pan. 2009. « The Epitope Regions of H1-Subtype Influenza A, with Application to Vaccine Efficacy ». Protein Engineering Design and Selection 22 (9): 543‑46. https://doi.org/10.1093/protein/gzp027.
Lee, Min-Shi, et Jack Si-En Chen. 2004. « Predicting Antigenic Variants of Influenza A/H3N2 Viruses ». Emerging Infectious Diseases 10 (8): 1385‑90. https://doi.org/10.3201/eid1008.040107.
Lees, William D., David S. Moss, et Adrian J. Shepherd. 2010. « A Computational Analysis of the Antigenic Properties of Haemagglutinin in Influenza A H3N2 ». Bioinformatics 26 (11): 1403‑8. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq160.
Qi, X., et C. P. Lu. 2006. « Genetic Characterization of Novel Reassortant H1N2 Influenza A Viruses Isolated from Pigs in Southeastern China ». Archives of Virology 151 (11): 2289‑99. https://doi.org/10.1007/s00705-006-0796-x.
Skowronski, Danuta M., Naveed Z. Janjua, Suzana Sabaiduc, et al. 2014. « Influenza A/Subtype and B/Lineage Effectiveness Estimates for the 2011–2012 Trivalent Vaccine: Cross-Season and Cross-Lineage Protection With Unchanged Vaccine ». The Journal of Infectious Diseases 210 (1): 126‑37. https://doi.org/10.1093/infdis/jiu048.
Stray, Stephen J., et Lindsey B. Pittman. 2012. « Subtype- and Antigenic Site-Specific Differences in Biophysical Influences on Evolution of Influenza Virus Hemagglutinin ». Virology Journal 9 (1): 91. https://doi.org/10.1186/1743-422X-9-91.