Principaux clades pour les sous-types H1 et H3 dans Octoflu (2019-2023)

Le nom des clades rapportés dans cette page sont ceux qui étaient inclus dans la base de données de référence de l'outil Octoflu entre 2019 et 2023 1) avec un ajustement mineur pour deux clades 2). .

Dans la mise à jour récente, il y a eu quelques changements de certains noms de clades (ex: clade H1 alpha-3 devient le clade H1 alpha-del). Le système de classification actuel est accessible sur la page classification OctoFlu (2023).

Dans le tableau, le premier nom correspond à l'identification du virus utilisé au Canada et au Québec. Le nom entre parenthèses est un système utilisé dans d'autres parties du monde tel que la communauté européenne (nom_CE). Vous trouverez plus d'informations sur la page Clades et lignées.

Nom du clade (nom_CE) Nom du clade (nom_CE)
1H1 alpha (1A.1.1) 12H3 I (3.1990.1)
2H1 alpha2 (1A) 13H3 IV (3.1990.4)
3H1 alpha3 (1A.1.1) 14H3 IVA (3.1990.4.1)
4H1 alpha3a (1A.1.1) 15H3 IVB (3.1990.4.2-3)
5H1 beta (1A.2) 16H3 IVC (3.1990.4.4)
6H1 delta1 (1B.2.2.2) 17H3 IVD (3.1990.4.5)
7H1 delta2 (1B.2.1) 18H3 IVE (3.1990.4.6)
8H1 gamma (1A.3.3.3) 19H3 IVF (3.1990.4.7)
9H1 gamma2 (1A.3.2) 20H3 2010.1 (3.2010.1)
10H1 pdm (1A.3.3.2) 21H3 2010.2 (3.2010.2)
11H1 pdm-vaccine (1A.3.3.2)
1)
Chang, J., Anderson, T.K., Zeller, M.A., Gauger, P.C., and Vincent, A.L. (2019). “octoFLU: Automated classification to evolutionary origin of influenza A virus gene sequences detected in U.S. swine” Microbiology Resource Announcements 8(32), e00673-19. L'outil est disponible en mode «Open Source» sur GitHUB.
2)
Le clade “2010-human_like” est renommé 2010.1 et le clade “2016-human_like” est renommé 2010.2