Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- portrait_quebec_clades [2020/12/18 14:03] – Christian Klopfenstein
+++ portrait_quebec_clades [2023/09/24 14:28] (Version actuelle) – Christian Klopfenstein
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-===== Portrait de la circulation des virus influenza (clades HA) =====
+===== Portrait de la circulation des virus influenza (clades H1 et clades H3) =====
+//**Ce portrait a été réalisé en 2019**//
-L'équipe santé et biosécurité du CDPQ a demandé aux trois laboratoires du Québec (Biovet, Demeter et FMV) de réaliser un portrait de la circulation des virus influenza avec les données disponibles dans leur base de données respective.
+L'équipe santé et biosécurité du CDPQ a demandé aux trois laboratoires du Québec (Biovet, Demeter et FMV) de réaliser un portrait des différents clades de virus influenza, qui circulent dans les fermes du Québec, avec les données disponibles dans leur base de données respective.
 Pour maximiser la cohérence des propos, l'équipe du CDPQ a donné un cadre de travail pour préciser les attentes ([[methodeportrait|voir ici]]).
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   * Faire une analyse de la diversité des souches Influenzas A (H1 et H3) en circulation dans les fermes porcines du Québec pour vérifier le nombre de clades et/ou souches qui devraient être incluses dans un éventuel vaccin provincial (régional). Le système de classification proposé par chaque laboratoire pourrait être celui qui est utilisé aux États-Unis ou un autre système.
   * Faire une analyse des sites antigéniques reconnus ou tous autres éléments reconnus dans la classification des souches.
   * Expliquer les grands principes du modèle retenus par le laboratoire pour comparer les clades et identifier les souches qui seraient éventuellement retenus pour faire un vaccin.
+  * Les données de séquençage de la partie HA des virus influenza A échantillonnés sur les fermes porcines du Québec et du Canada au courant des deux dernières années (2018 et 2019).
+  * Chaque laboratoire pourra utiliser ses propres données et éventuellement inclure les séquences du Québec partagées sur les bases de données publiques 3) (à la discrétion de chaque laboratoire).
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-==== Rapport de Demeter (Québec) ====
+==== Rapports de Demeter (Québec) ====
   * Tous les documents transmis ([[https://cdpq02.ca/DOMinfluenza/docs/Demeter/|voir ici]])
   * Le rapport synthèse, séquences 2017-2020 ([[https://cdpq02.ca/DOMinfluenza/docs/Demeter/portrait_influenza_quebec_demeter_2017-2020.pdf|voir ici]])
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-==== Rapport de la FMV (Québec) ====
+==== Rapports de la FMV (Québec) ====
   * Tous les documents transmis ([[https://cdpq02.ca/DOMinfluenza/docs/FMV/|voir ici]])
   * Le rapport synthèse, séquences 2018-2020 ([[https://cdpq02.ca/DOMinfluenza/docs/FMV/portrait_influenza_quebec_fmv_2018-2020.pdf|voir ici]])