Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- influenza_aa [2020/10/23 06:18] – Christian Klopfenstein
+++ influenza_aa [2020/10/23 06:37] (Version actuelle) – [Abréviation pour les acides aminés dans les analyses de séquences] Christian Klopfenstein
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 ===== Abréviation pour les acides aminés dans les analyses de séquences =====
-Le tableau ci-dessous [[https://fr.wikipedia.org/wiki/Acide_amin%C3%A9_prot%C3%A9inog%C3%A8ne |adaptation de Wikipédia]] présente les codons d'ARN messager correspondant à chacun des 22 acides aminés protéinogènes. Les valeurs relatives à l'abondance relative des acides aminés dans les protéines varient légèrement suivant les espèces et les bases de données utilisées. Elles sont données ici à titre indicatif.
+Le tableau ci-dessous présente les codons d'ARN messager correspondant à chacun des 22 acides aminés protéinogènes [[https://fr.wikipedia.org/wiki/Acide_amin%C3%A9_prot%C3%A9inog%C3%A8ne |Adaptation de Wikipédia]].
-^Acide aminés^Court^Abbrev.^Codon(s)^Nucléotides (n)^
-|Alanine|A|Ala|GCU, GCC, GCA, GCG|12|
-|Cystéine|C|Cys|UGU, UGC|6|
-|Aspartic acid|D|Asp|GAU, GAC|6|
-|Glutamic acid|E|Glu|GAA, GAG|6|
-|Phenylalanine|F|Phe|UUU, UUC|6|
-|Glycine|G|Gly|GGU, GGC, GGA, GGG|12|
-|Histidine|H|His|CAU, CAC|6|
-|Isoleucine|I|Ile|AUU, AUC, AUA|9|
-|Lysine|K|Lys|AAA, AAG|6|
-|Leucine|L|Leu|UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG|18|
-|Méthionine|M|Met|AUG|3|
-|Asparagine|N|Asn|AAU, AAC|6|
-|Pyrrolysine|O|Pyl|UAG*|4|
-|Proline|P|Pro|CCU, CCC, CCA, CCG|12|
-|Glutamine|Q|Gln|CAA, CAG|6|
-|Arginine|R|Arg|CGU, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG|18|
-|Serine|S|Ser|UCU, UCC, UCA, UCG, AGU, AGC|18|
-|Threonine|T|Thr|ACU, ACC, ACA, ACG|12|
-|Selenocysteine|U|Sec|UGA**|5|
-|Valine|V|Val|GUU, GUC, GUA, GUG|12|
-|Tryptophan|W|Trp|UGG|3|
-|Tyrosine|Y|Tyr|UAU, UAC|6|
-|Stop codon|-|Term|UAA, UAG, UGA|9|
-^Moyenne^  ^  ^  ^8^
+^ ^Abbrev.^^Codon(s)^Codons synonymes (n)^
+|Alanine|A|Ala|GCU, GCC, GCA, GCG|  4  |
+|Cysteine|C|Cys|UGU, UGC|  2  |
+|Aspartic acid|D|Asp|GAU, GAC|  2  |
+|Glutamic acid|E|Glu|GAA, GAG|  2  |
+|Phenylalanine|F|Phe|UUU, UUC|  2  |
+|Glycine|G|Gly|GGU, GGC, GGA, GGG|  4  |
+|Histidine|H|His|CAU, CAC|  2  |
+|Isoleucine|I|Ile|AUU, AUC, AUA|  3  |
+|Lysine|K|Lys|AAA, AAG|  2  |
+|Leucine|L|Leu|UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG|  6  |
+|Methionine|M|Met|AUG|  1  |
+|Asparagine|N|Asn|AAU, AAC|  2  |
+|Pyrrolysine|O|Pyl|UAG avec élément PYLIS|  1  |
+|Proline|P|Pro|CCU, CCC, CCA, CCG|  4  |
+|Glutamine|Q|Gln|CAA, CAG|  2  |
+|Arginine|R|Arg|CGU, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG|  6  |
+|Serine|S|Ser|UCU, UCC, UCA, UCG, AGU, AGC|  6  |
+|Threonine|T|Thr|ACU, ACC, ACA, ACG|  4  |
+|Selenocysteine|U|Sec|UGA avec élément SECIS|  1  |
+|Valine|V|Val|GUU, GUC, GUA, GUG|  4  |
+|Tryptophan|W|Trp|UGG|  1  |
+|Tyrosine|Y|Tyr|UAU, UAC|  2  |
+|Codon-Stop|-|Term|UAA, UAG, UGA|  3  |